欢迎来到论文网! 识人者智,自知者明,通过生日认识自己! 生日公历:
网站地图 | Tags标签 | RSS
论文网 论文网8200余万篇毕业论文、各种论文格式和论文范文以及9千多种期刊杂志的论文征稿及论文投稿信息,是论文写作、论文投稿和论文发表的论文参考网站,也是科研人员论文检测和发表论文的理想平台。lunwenf@yeah.net。
您当前的位置:首页 > 科技论文 > 生物论文

利用ILP分子标记分析籼粳杂交水稻的遗传多样性_聚类分析-论文网

时间:2014-12-14  作者:赵建亚 张瑛英 梁康迳

图1引物2123

Fig.1primer2123

图2引物3797

Fig.2primer3797

注:1-52分别代表9311,日本晴,KentaNangKa,嘉南9号,明恢72,2428,92gk729,97gk419,97gk1019,97gk1037,97gk2046,20gk719,47粳,华明921,WJ413,多系1号,亚恢420,明恢86,R527,MHR18,超引一号,9308,明恢398,明恢413,明恢416,明恢417,明恢419,明恢436,明恢3009,明恢502,明恢503,明恢504,明恢506,明恢507,明恢508,明恢509,明恢510,明恢511,明恢512,明恢513,明恢514,明恢515,明恢516,明恢517,明恢519,明恢523,明恢524,明恢527,明恢530,明恢532,明恢533,明恢534。

作进一步检测时,用筛选的58对ILP引物对52份试验材料进行扩增,其中引物2123和引物3797扩增结果见上图1、图2。

2.2系统聚类分析

由图3可知,从相似系数0.74处分开,供试的52个亲本和品系经58对水稻特异ILP引物的PCR扩增检测,可以明显地分为两大类;若从相似系数0.45处分开,供试的52个亲本和品系可分为7类。但为了更清晰的界定本材料的亲缘关系,本试验选定了从相似系数0.67处分开,可分为籼稻,中间型和粳稻三大类,这3种类中第三类最多,其中差异最大的品种间相似系数为0.51,籼型包含在该类型中,其相似系数较相近,它们之间差异不大;中间型包括4个品种;粳型虽包含较少品种(7个),但它们之间的差异较大,差异最大的品种间相似系数也有0.67。

3讨论

由于环境因素的影响,传统的形态特征很难鉴定出种质资源的亲缘关系。本研究采用ILP分子标记对供试材料进行亲缘关系分析,由于ILP分子标记所用的引物长度一般在15-20bp左右,退火温度在55-60℃之间,保证了引物扩增的重复性和特异性,提高了分类结果的准确性,所以此方法作为籼粳亚种种质资源的聚类分析,结果比较稳定可靠,可为亲本选配提供可靠的分子水平信息。

同时,我们也要注意到标记数目的选择对结果的可靠性有很大的影响,标记数目太少,所获得的结果具有较大的随机性,并不能反映亲本之间的真实亲缘关系。而前人的诸多研究中,使用的标记数量都较少,段世华等选用分布于水稻12条染色体上的25对SSR标记,分析了生产中广泛应用的35个杂交水稻恢复系。朱作峰等用30对SSR标记比较了52份不同生态型的栽培稻和34份不同省(区)的普通野生稻的遗传多样性。谢建坤等利用14对SSLP标记对东乡野生稻进行多样性分析。和本研究相比,其他研究者在研究对象的数量上比本实验多出很多,这也决定了他们在标记数量的选择上不可能太多,但从本研究结果来看,标记数量的选择对结果具有很大的影响,只有标记数达到一定数量,所得结果才较为可靠。

基于50个籼粳种质资源的聚类结果,我们还可以从中选择第二、第五和第六类群(以分成七个类群为例)作深入的研究,即从第二类群粳稻品系中的第1号品系,第五类群13个籼型品系中的第5、6、11、13号品系,第六类群的籼型品系第13、24号,选择按不同年代育成主要以籼稻为主的共7个品系,作为恢复系进一步研究。通过对其产量和茎杆性状的遗传效应和杂种优势测定,分析亲本遗传特点与利用潜力,以便寻找到最优配置,为今后育种方案的制订提供依据。

图352个籼粳种质资源聚类图

Fig.352IndicaandJaponiceidioplasmresourcesclusterpicture

参考文献
1 Grodzicker,T.et al.Physical mapping of Temeraturesensitive Mutations of adenoviruses Cold Spring HarborSymp[J].Quant.Biol,1974,39: 439-446.
2 Liu D L,Lovett J V,Biologically active secondary metabolites of barley.II.Phytotoxicity of barley allelochemicals[J].Journalof Chemical Ecology,1993,19:2231-2244.
3 赵向前.水稻内含子长度多态性分子标记的开发和应用[D].浙江大学,2007
4 卢泳全,汪旭升,黄伟素,等.基于水稻内含子长度多态性开发禾本科扩增共有序列遗传标记[J].中国农业科学,2006,39(3):9-15.
5 现代植物生理学实验指南[M]. 中国科学院上海植物生理研究所,上海市植物生理学会主编, 科学出版社, 1999, 337.
6 段世华,毛加宁,朱英国.用微卫星DNA标记对我国杂交水稻主要恢复系遗传差异的检测分析[J].遗传学报.2002.29(3):250-254.
7 朱作峰,孙传清,付永彩,等.用SSR标记比较亚洲栽培稻与普通野生稻的遗传多样性[J].中国农业科学,2002.35(12):1437-1441.
8 谢建坤,陈大洲,肖叶青,等.应用微卫星标记分析东乡野生稻遗传多样性[J].中国农业科学,2003,36(8):873-878.

查看相关论文专题
加入收藏  打印本文
上一篇论文:植物雄性不育的遗传与应用探讨_恢复系-论文网
下一篇论文:黄皮果研究文献计量分析-论文网
科技论文分类
科技小论文 数学建模论文
数学论文 节能减排论文
数学小论文 低碳生活论文
物理论文 建筑工程论文
网站设计论文 农业论文
图书情报 环境保护论文
计算机论文 化学论文
机电一体化论文 生物论文
网络安全论文 机械论文
水利论文 地质论文
交通论文
相关生物论文
最新生物论文
读者推荐的生物论文