| Blast比较结果中的Score分值为244～1399，其中rbcS-mc与尖叶蕉1，5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基rbcS1基因（AF008214）的相似性最高，Score分值为1399，一致性（identity）为98%（789/803）。
2.6香蕉1，5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基编码氨基酸序列的同源性分析
以cDNA序列推导的氨基酸序列进行BLASTP分析，结果显示所有的与该序列具有同源性的蛋白质都是rbcS蛋白。在NCBI蛋白质数据库中，共搜索到与rbcS-mc编码氨基酸有一定相似性的序列100条，其中相似性最高是小果野蕉（登记号为AAB63287），为98%（177/180）。将香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基氨基酸序列与其他植物rbcS氨基酸序列进行多序列比对,发现在所比对的氨基酸序列中MVAPFTGLKS、ETLSYLP、YDGRYWTMWKLP及RQVQCISFI四个序列高度一致。香蕉1，5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因编码了一个由281个氨基酸残基组成的蛋白质,其氨基酸序列与小果野蕉的氨基酸序列同源性达98%，二者长度相同，只有三个氨基酸差异,即在68位置上香蕉是Leu而小果野蕉是Val，在79位置上香蕉是Leu而小果野蕉是Met，在85位置上香蕉是Leu而小果野蕉是Val（图5）。
Ⅰ-MASSMLSSAAVVTSP----AQATMVAPFTGLKSSAAFPVTRKTNKDITSITSNGGRVSCMKVWPPIGKKKF67
Ⅱ-MASSMLSSAAVVTSP----AQATMVAPFTGLKSSSAFPVTRKANNDITSIVSNGGRVSCMKVWPPVGKKKF67
Ⅲ-MASSVMSSAAVATRGNG--AQASMVAPFTGLKSAASFPVSRKQNLDITSIASNGGRVRCMQVWPPINMKKY69
Ⅳ-MASSIVSSAAVATRGNG--AQASMVAPFTGLKSTASFPVSRKQNLDITSIASNGGRVSCMQVWPPINMKKY69
Ⅴ-MASSVLSSAAVATRTNV--AQANMVAPFTGLKSAASFPVSRKQNLDITSIASNGGRVQCMQVWPPYGKKKY69
Ⅵ-MASSILSSAAVASVNSASPAQASMVAPFTGLKSSAGFPITRKNNVDITTLASNAGKVQCMKVWPPLGLRKF71
Ⅶ-MASISSSAVATVNRSTP--AQASLAAPFTGLKSNVAFPVTKKANNDFSSLPSNGGRVQCMKVWPPIGLKKY69
ⅧMVSSMMVSSAATFTRASP--AQSSMVAPFTGLKSASAFPVTRKPNADLSHLPSNGGRVQCMKVWPIEGLKKF70
ⅨMVSSMMVSSAATFTRASP--AQSSMVAPFTGLKSASAFPVTRKPNADLSHLPSNGGRVQCMKVWPIEGVKKF70
ⅠETLSYLPDLSDVELAKEVDYLLRNKWIPCVEFELEHGFVYREHGNTPGYYDGRYWTMWKLPLFGCTDSAQVL139
ⅡETLSYLPDLTEVELGKEVDYLLRNKWIPCVEFELEHGFVYREHGSTPGYYDGRYWTMWKLPLFGCTDSAQVL139
ⅢETLSYLPDLSDEQLLKEVEYLLKNGWVPCLEFETEHGFVYRENNKSPGYYDGRYWTMWKLPMFGCTDATQVL141
ⅣETLSYLPDLSDEQLLSEIEYLLKNGWVPCLEFETEHGFVYRENHKSPGYYDGRYWTMWKLPMFGCTDATQVL141
ⅤETLSYLPDLSEEQLLSEIEYLLKNGWVPCLEFETERGFVYRENNKSPGYYDGRYWTMWKLPMFGCTDATQVL141
ⅥETLSYLPDMSNEQLSKECDYLLRNGWVPCVEFDIGSGFVYRENHRSPGFYDGRYWTMWKLPMFGCTDSSQVI143
ⅦETLSYLPPLSDEALSKEIDYLIRNKWVPCLEFELEHGFVYREHHHSPGYYDGRYWTMWKLPMFGCTDSAQVM141
ⅧETLSYLPTLKDEALLKQIEYLLRSKWIPCLEFCPK-GFVWRENHRSPGYYDGRYWTMWKLPMFGCTDAVQVA141
 ⅨETLSYLPTMKDEALVKQIEYLLRSKWIPCLEFCPK-GFVWRENHRSPGYYDGRYWTMWKLPMFGCTDAVQVA141
ⅠKEVEECKKEYPGAFIRIIGFDNTRQVQCISFIAYKPPSFTEA----181
ⅡKEVQECKTEYPNAFIRIIGFDNNRQVQCISFIAYKPPSFTGA----181
ⅢAEVEEAKKAYPQAWIRIIGFDNVRQVQCISFIAYKPEGY-------180
ⅣAEVQEAKKAYPQAWVRIIGFDNVRQVQCISFIAYKPEGY-------180
ⅤAEVGEAKKAYPEAWIRIIGFDNVRQVQCISFIAYKPEGY-------180
ⅥQEIEEAKKEYPDAFIRVIGFDNVRQVQCISFIAYKPQVLLFLSSIC189
ⅦKEVGECKKEYPNAFIRVIGFDSVRQVQCISFIVSKPPGVL------181
ⅧKEVEECKKEYPHAFIRIIGFDNNRQVQCISFIAYKPTGY-------180
 ⅨKEVEECKKEYPHAFIRIIGFDNNRQVQCISFIAYKPTGY-------180
图5香蕉rbcS推断的氨基酸序列与其它物种的rbcS家族氨基酸序列的同源对比
黑色区域：所有基因的保守氨基酸残基
Fig.5AlignmentofthepredictedaminoacidsequencesfrombananaandseveralotherrbcSgenes
Residueshighlightedinblackareconservedinallofthesequencesdepicted
Ⅰ拟南芥（Arabidopsis）；Ⅱ油菜（BrassicanapusL）；Ⅲ马铃薯（Solanumtuberosum）；Ⅳ番茄（Lycopersiconesculentum）；Ⅴ普通烟草（Nicotianatabacum）；Ⅵ黄瓜（Cucumissativus）；Ⅶ莴苣（Lactucasativa）；Ⅷ香蕉（Musaacuminate）；Ⅸ小果野蕉（Musaacuminata）
基于rbcs-mc氨基酸序列构建系统进化树，从树的聚类看，芭蕉科的香蕉和小果野蕉与菊科的莴苣聚为一类；十字花科的拟南芥和油菜聚为一类；茄科的马铃薯，番茄和烟草聚为另一类，而葫芦科的黄瓜单独为一类。 3/4 首页 上一页 1 2 3 4 下一页 尾页 |
