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中国野生华东葡萄抗白粉病相关基因pUSP的克隆及功能分析-论文网

时间:2013-12-18  作者:赵莘,朱自果,王跃进

论文摘要:本实验以中国野生华东葡萄株系白河-35-1为材料,从白粉病病原菌诱导的cDNA 文库中筛选到一条与胁迫相关的EST序列。利用RACE技术获得基因全长为836 bp,编码一个175个氨基酸的广谱抗性相关蛋白(VpUSP)(登录号:GU946975)。利用半定量RT-PCR技术,研究了VpUSP在中国野生华东葡萄抗病、感病株系中RNA水平上的表达方式,结果表明华东葡萄感病株系在接种白粉病前后均有表达,且表达量变化不明显;抗病华东葡萄株系在接种白粉病后VpUSP基因表达量呈增加趋势,48h时达到表达高峰而后降低,这表明VpUSP基因参与了中国野生华东葡萄的抗白粉病过程。
论文关键词:中国野生葡萄,基因克隆,白粉病

葡萄白粉病(UncinulanecatorSchw.Burr)是严重危害世界的一种真菌性病害。在葡萄著名产区如美国加州,法国,意大利,澳大利亚,中国新疆等地区,葡萄白粉病比较严重,给葡萄生产造成很大的经济损失。利用基因工程手段与传统育种技术相结合,发掘抗病葡萄种质的抗病基因,培育抗病新品种是解决此问题的有效途径之一。

USP蛋白是一种普遍存在于植物中的抗性相关蛋白,一般存在于细胞质中,在植物受到外界胁迫时表达上调,增强植物的抗逆性。USP相关蛋白在水稻中至少由10个基因编码,在拟南芥中由17个基因编码,它们都被定位在第5条染色体上。在许多双子叶植物与单子叶植物受到非生物胁迫时,克隆到USP相关基因,但在植物受到生物胁迫时的相关基因克隆方面还未见报道。

本研究从野生华东葡萄株系白河-35-1白粉病病原菌诱导的cDNA文库获得一条抗性相关EST序列,利用RACE技术获得基因全长。并利用半定量RT-PCR技术,研究在中国野生华东葡萄抗病、感病株系白粉菌诱导条件下VpUSP基因的表达变化方式,为深入研究该基因的在中国野生华东葡萄上的抗病性奠定了基础。

通讯作者:Tel:029-87082803.E-mail:wangyuejin@263.net

1材料和方法

1.1试剂和试材

感病华东葡萄株系:白河-35-2,“6-12-2”,广西-2;抗病华东葡萄株系:白河-35-1,“6-12-6”,白河-13-1;在西北农林科技大学葡萄种质资源圃进行接种实验;在接种前首先对要接种的叶片进行套袋1周,然后选取健康无病的幼叶,用无菌蒸馏水喷湿接种叶片的上叶面,取用田间自然条件下欧洲葡萄感白粉病的叶片,用病叶压片法人工接种葡萄白粉病病原菌,接种后立即套袋。在接种后0h,6h,12h,24h,48h,72h,96h剪取1.0cm2大小的幼叶叶片,立即放置液氮中。

本研究中RACE试剂盒购自Clontech(美国)公司,反转录试剂盒、pGEMT-easyVector载体购自Promage(美国)公司。DL2000Marker、rTaq酶均为TaKaRa公司产品,其他试剂均为国产或进口分析纯。

1.2方法

1.2.1中国野生华东葡萄株系叶片总RNA的提取

采用改进的SDS∕酚法分别提取经接种白粉病菌诱导0、6、12、24、48、72、96hRNA,然后等量混合。1%的琼脂糖凝胶电泳检测完整性,紫外分光光度计检测纯度和浓度。

1.2.2中国野生华东葡萄VpUSP全长基因的克隆

根据已获得的来源于华东葡萄白河-35-1白粉菌诱导的cDNA文库中的EST序列(GenBank登录号:GR884460),设计RACE特异引物。

GSP1:5'GGTGTGGGGAAAATGGAGAGTGAGCC3'

GSP2:5'CGCTTGCTGCTAATAGAGGGGTGTGGAT3'

以接种白河-35-1叶片RNA为模板,参照RACE试剂盒说明书进行反转录,合成cDNA。RACE-PCR扩增参照试剂盒说明,以GSP1,GSP2为引物,进行PCR,产物回收,连接到p-GEMTeasy载体上,转化,挑取阳性克隆并测序,得到VpUSP基因5'端序列和3'端序列。利用DNAstar软件将获得的基因序列进行拼接,获得全长cDNA序列。

1.2.3中国野生华东葡萄VpUSP基因的生物信息学分析

获得的中国野生华东葡萄含VpUSP的全长基因ORF的查找和核苷酸翻译在GenBank的ORFFinder(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)上完成;在NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)网站上进行Blastx蛋白序列分析;用DNAstar进行进化树分析基因的相似性;蛋白质三维模型的同源建模均使用(http://www.expasy.org)网站的相关生物信息学分析软件进行。

1.2.4中国野生华东葡萄VpUSP基因诱导表达分析

以白粉菌诱导中国华东葡萄感病和抗病6株系反转录产物为模板,根据VpUSP全长基因设计引物

VpUSP1:5AGAGTGAGCCAACTCGG3

VpUSP2:5TCAGTCATCAACTGGGTC3

根据编码3-磷酸甘油醛基因设计内参引物

GAPDH1:5AACATTGTGCCAACATCCA3

GAPDH2:5ACCCCATTCATTGTCATAC3

分别以上述两组引物进行PCR扩增,PCR扩增体系为:10×PCR缓冲液(Mg2Plus)2.5μl,dNTPs(2.5mM)2μl,上游引物和下游引物各1μl,rTaq0.125μl,反转录产物1μl,超纯水补齐至25μl。PCR反应条件为:预变性94℃3min;进入如下循环:94℃30S,Tm52℃30S,72℃1min;25个循环;72℃延伸10min,4℃保存。

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