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梨果皮色泽变异品种(系)的AFLP与SRAP标记鉴定-论文网

时间:2013-12-18  作者:赵广,乐文全,路娟,张绍铃,李俊才,吴俊
2.2AFLP标记鉴定色泽变异品种(系)

54对AFLP引物组合在南果与南果红色变异系中可扩增条带数为1035条,可检测的多态性条带为7条,占总条带数的0.64%;考密斯及其色泽变异的4个品种(系)可检测条带数1080,其中多态性条带为101,多态性比率为9.32%。所检测的引物中,有7对引物M-CAG/E-AAC、M-CAG/E-ACC、M-CAT/E-ACG、M-CAT/E-ACC、M-CTA/E-AAG、M-CTA/E-ACT、M-CTC/E-AGG能将南果与其红色变异系区分开;有3对引物M-CAT/E-ACC、M-CTA/E-AAG、M-CTA/E-ACT能将考密斯、红考密斯、早红考密斯与其绿色变异系一一区分开(表2);所有的54对AFLP引物均无法区分红安久及其绿色变异系。另外,考密斯及其色泽变异的4个品种(系)中34对引物能区分其中的2个品种(系),8对引物能区分其中的1个品种(系)。采用Nei-Li相似性系数的计算方法得出,南果与南果红色变异系之间的相似系数为0.965,考密斯及其色泽变异品种(系)之间的相似系数为0.878。

图1不同AFLP引物揭示的遗传差异

1~8.不同品种资源(编码同表1)

Fig.1GeneticdifferencerevealedbydifferentAFLPprimerpairs

1~8.Differentcultivarsoraccessions(codessequenceshownasTable1)

2.3SRAP标记鉴定色泽变异品种(系)

20对SRAP引物组合在南果与南果红色变异系中可扩增条带数为198条,可检测的多态性条带为3条,占总条带数的1.43%;考密斯及其色泽变异4个品种(系)可检测条带数202条,其中多态性条带为14条,多态性比率为7.14%。所检测的引物中,有3组引物em7/me3、em8/me7、em11/me5可分别将南果及其红色变异系鉴定开;em11/me5能将考密斯、红考密斯、早红考密斯与其绿色变异系一一区分(表2);所有SRAP引物不能将红安久及其绿色变异系鉴定开。另外,考密斯及其色泽变异

图2不同SRAP引物揭示的遗传差异

1~8.不同品种资源(编码同表1)

Fig.2GeneticdifferencerevealedbydifferentSRAPprimerpairs

1~8.Differentcultivarsoraccessions(codessequenceshownasTable1)

的4个品种(系)中3对引物能区分其中的2个品种(系),9对引物能区分其中的1个品种(系)。对扩增结果采用Nei-Li相似性系数的计算方法,南果与南果红色变异系之间的相似系数为0.984,考密斯及其色泽变异品种(系)之间的相似系数为0.912。

表2变异品种(系)产生差异片段结果

Table2Polymorphicfragmentbythevariantcultivars(strains)

引物

Primers

长度(bp)

Length(bp)

南果

Nanguo

南果红色变异系

Red variant strain of Nanguo

考密斯 Doyenne du Comice

红考密斯

Red Doyenne du Comice

早红考密斯

Early red Doyenne du Comice

早红考密斯绿色变异系Green variant strain of Early red Doyenne du Comice

M-CAG/E-AAC

255

1

0

1

1

1

1

M-CAG/E-ACC

300

1

0

0

0

0

0

M-CAT/E-ACG

290

0

1

1

1

1

1

M-CAT/E-ACC

350

1

1

0

1

0

0

320

1

0

1

0

0

0

238

1

1

0

1

0

1

M-CTA/E-AAG

272

0

0

1

1

0

0

265

0

0

0

1

0

0

230

1

0

0

1

0

1

M-CTA/E-ACT

285

1

0

1

1

0

1

274

1

1

1

0

1

1

246

1

1

0

1

0

1

M-CTC/E-AGG

256

1

0

0

1

0

1

em7/me3

300

1

0

0

0

0

0

em8/me7

201

0

1

0

0

0

0

em11/me5

700

0

0

0

0

1

1

296

0

0

0

1

0

0

270

1

1

0

0

1

0

242

0

1

1

1

1

1

2.4不同品种(系)的指纹图谱及系谱关系

综合AFLP与SRAP标记的检测结果,获得4个品种(系)的特征谱带,南果梨在引物M-CAG/E-ACC300bp和em7/me3310bp(图2)处有特征带;红考密斯在引物M-CAT/E-AGG370bp和em11/me5296bp(图1、2)处有特征条带;早红考密斯在引物em8/me3240bp和em11/me3220bp(图2)处有特征带;早红考密斯绿色变异品系在em8/me3220bp(图2)处有特征带。特征带是进行品种或类型鉴别的重要指标,依据以上特征指纹我们可以将其从供识材料中立即识别出来。此外,指纹图谱还揭示了供试材料间的差异谱带,如考密斯在引物M-CAT/E-ACA240bp条带处缺失,其它品种(系)均有该条带扩增(图1);早红考密斯的绿色变异在引物em7/me3315bp条带处表现缺失,其它品种(系)有条带扩增。SRPA引物em11/me5可区分除红安久及其变异系以外的所有供试材料,可应用于品种(系)的分子鉴别。

利用NTSYSpc2.02对8份供试材料的AFLP和SRPA谱带进行聚类分析,结果如图3。根据相似系数0.8可将所有品种分为2个类群,属东方梨的南果梨及其变异聚为一类,而其他6个西洋梨及其变异类型聚为另一类群,表明了东方梨与西方梨具有较远的遗传关系。在西洋梨类群中,各变异类型与其相应的原始品种表现出较高的相似性。

图3AFLP标记和SRAP标记结果聚类图

品种1~8同表1所示

Fig.3DendrogramofAFLPMarkandSRAPMark

Cultiavr1~8:notedasTable1

3讨论

3.1果树突变的鉴定方法

可用于突变鉴定的主要方法有形态学观察、同工酶分析、染色体变异数量与结构的检测、孢粉学研究和分子标记技术。

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