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香蕉凝集素基因启动子5’远端的分离、分析及鉴定_果实特异表达-论文网

时间:2014-04-10  作者:张建斌,金志强,王纪,刘菊华,贾彩红,徐碧玉
取轰击后的香蕉根、叶片和果实薄片于26℃暗培养24~48h。然后进行荧光显微镜观察、组织化学染色和基因枪轰击后24h的转化材料GUS活性比色测定,以GUS提取液中每mg总蛋白在1min中生成对硝基苯酚的微摩尔数为一个酶活单位。

2结果与分析

2.1序列分析

对BanLec序列进行NCBIBLASTn比对分析,结果表明670bp的连续序列与BanLec启动子(登录号为DQ7939.1)同源性在97%,有340bp的序列是首次分离(图7),证明1014bp序列为香蕉凝集素基因的上游序列,如图1。

图1NCBI比对结果

Fig.1ResultofNCBIblastn

通过Promoterpredictions、PlantCARE等软件进行基础启动子区及调控元件分析,结果表明在-89~-138bp,-221~-270bp和-499~-548bp存在三处可能的基本启动子区。可能含有32个顺式作用元件,并含有OSE1ROOTNODULE等多个组织特异作用元件(图2、表1)。

CCCAAAATAACATCGTTAGAGAGGAGGATAGTTGACCTCCTTCATTCTCTCCCATAAATATGTAGGAACTCAGGGATATACGATTTCCCTAGATAACACAATCTCCTTTGTACGCGCGGTTTTCTATTTTACGAGTTTTTACATGTCAAGCTTCGCAAGATGACGAACACCTTTTAGAAAATTTGAGATTTTTATTTTCTATTTTTCCACTGCATATGTGATGTCGCCCTTAGATTTCCCTATGGTTGTGTCATATTGATACTTATACATAAGAACTTTTTGAGATGATATATTACCTTGGATTCCTTGTTACGAGATCATTTGTGGCTTACAAAATTCATCTTTGTATTATGAATTGTCCATCAAGTATTTTTAATTTATTTTTTATAAATTCTTAAAAGATCCTAGAACGTTAATCCCTTTGGATCAATATATAAAAGTGACATACGACTTAGAAAAAATCAAATAAAATTAAATATAAATATATATTTATGAAGAATAAATTAAAATTTTGTATTACTTAATCATATCCTACATATCTACGATCTGCACCATCAAACCAAAAAAAAAGGGGGTTATCTCTCCAACGTAGCCGAAGTATTGAACTCTCAAGTCCCCCCAACACGTTTCCATGTGTCGACCGCCACGCCATATCCTTATCCGCTCCTCTTTAATTATTGACCACACCACCATCCGTGATCGTCGCCAGTCACGTCTTCGTCGTCGAGAGGCTCTACACGACCCTCGTCACGTGATACACGCTTTCCTCGAGGAAGCCACGGGCGAGGGGGTGAGCGGTACACCTCCATTCCACCCCGACATCAGAGCCATGGCGATCCGCTATAGGTAGCCTCTCTCCCTCTTCCCCAACATTATCTTCTGCAGAAGAAAGGGAGGAGTTTGGTACACACAACACGATGGTGAGAGGCTCTCTATACACACATAGTTTTCTGTCTGTGGAACAGTTTGGTTACCTCCGTGCGTCGTGTGTCGACGTC

图2BanLec基因启动子序列

(图2中:预测的基本启动子序列;转录起始位点CCA;TATA盒)。

Fig.2NucleotidesequenceofclonedBanLecgenepromoter

Predictedbasicelementsofpromoter,CCA:potentialinitialpointsoftranscription,TATA:TATAbox

名称

代表序列

序列中位点

功能

ABRE

ACGT

585750

脱落酸响应的顺式作用因子ABA反应元件

ACGTABOX

TACGTA

588

与糖压力相关

CAATBOX1

CAAT

255355428602679998

组织特异性元件

CAAT-box

CCCA

93128224284532

启动子及增强子区域通用的顺式作用元件

CGTCA-motif

CGTC

747

与茉莉酸响应有关的顺式调节元件

G-Box

CACA

624750

光反应顺式调控元件

WBOXNTERF3

TGAC

32160710

与伤害相关元件

GA-motif

AAAGATGA

337

缺氧特异诱导的类增强子元件

HSE

GAAA

175

热反应相关元件

I-box

ATAT

650

光反应相关元件

TATA-box

TATA

76126

核心启动子元件

TATC-box

TATC

193

赤霉素反应顺式元件

TCA_element

AGAA

549

水杨酸反应顺式元件

TCCC-motif

TCTC

280521

光反应元件

DPBFCOREDCDC3

ACACNNG

633

ABA反应相关元件

CANBNNAPA

CNAACAC

164621

胚与胚乳特异性元件

CATATGGMSAUR

CATATG

213

参与生长素调节

GATABOX

GATA

277592258287756

光控制元件和组织特异性表达元件

TATABOX5

TTATTT

192378

谷氨酰胺合成酶相关元件

WBOXATNPR1

TTGAC

32680991

水杨酸反应相关元件

WRKY71OS

TGAC

33161441681

赤霉素相关元件

OSE1ROOTNODULE

AAAGAT

398

组织特异性序列

PYRIMIDINEBOXOSRAMY1A

CCTTTT

170

赤霉素反应瞬时作用元件

TGA-box

TGAC

656

植物激素响应元件

Chs-CMA1a

TTAC

869

光响应元件

2.2瞬时表达结果

取基因枪转化24h香蕉叶、根、果在荧光显微镜下观察(图3)所示,转化香蕉凝集素基因启动子的植物表达载体p1304BanLec香蕉材料的根、叶均未发现绿色荧光,而只在果实中特异表达;含有35S启动子的pCAMBIA1304植物表达载体香蕉材料根、叶、果实均有绿色荧光;以水为阴性对照的根、叶、果实均没有绿色荧光。

以香蕉幼叶、根、果实为受体材料,基因枪法转化后,受体材料培养16h,染色24h结果如图4所示,p1304BanLec载体包被的微弹轰击的材料,叶片、根在显微镜下没有观察到蓝色,而果实薄片在果肉中观察到蓝色。pCAMBIA1304包被的微弹轰击的叶片、根、果实均在显微镜下观察到蓝色。水包被的微弹轰击的材料,叶片、根和果实薄片在显微镜下均未观察到颜色。

2.3pCAMBIA1304与p1304BanLec及pBIL2转化香蕉不同材料中GUS活性检测

基因枪转化后24小时取不同反应时间、相同重量的基因枪轰击的果实薄片制备GUS提取液,酶反应后测得415nm处两种果实转化材料GUS提取液不同反应时间的光吸收值,将其换算成消光产物量后对时间作图。

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