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龙眼资源遗传多样性的SCoT 和ISSR 分析-论文网

时间:2014-06-21  作者:陈虎,何新华,黄桂香,李峰,姜建初,朱建华,罗聪
由图可见,在遗传相似系数为0.672的水平上,将37份材料分为6组,其中四季蜜归为第1组。来自云南的云南-1、2、11归为第3组,越南V2为第四组,云南-9为第5组,龙荔为第6组。剩余30份材料归为2组。第2组在遗传相似系数为0.748水平有分为5个亚组,来自灵山的6份材料和崇左的2份材料及云南材料云南-3、6、7为第1亚组。来自泰国的6份材料归为第2亚组。那陈的2份材料为第3亚组。云南材料云南-4、5、8、10为第4亚组。除越南V2外的5份越南材料和龙州-1为第5亚组。

2.2ISSR标记聚类分析

利用UPGMA方法对SCoT扩增的结果构建聚类树状图(图2b)。由图可见,在遗传相似系数为0.685的水平上,除云南-4、8、9、泰国-3外,将其它32份材料分为6组。四季蜜为第1组,云南-5为第3组,那陈2份材料,崇左2份材料及龙州1份材料和越引-1,依登为第4组。云南-1、2、11为第5组。龙荔为第6组。其余材料为第2组。在遗传相似系数为0.727时将第2组分为5亚组。云南-3为第1亚组。来自灵山的6份材料为第2亚组。云南-3、7、

10和越南V3为第3亚组,来自越南的越南-2、3、4越南V1,V2为第4亚组。来自泰国的依器,苗翘及泰国-1、2为第5亚组。

2.3SCoT和ISSR标记综合分析

把SCoT和ISSR两种标记分析的数据综合后,37份材料的聚类分析结果如图3a所示,在相似系数0.715水平上,除云南-5外,可以将36分材料划分为6大类群。栽培品种四季蜜为第1组。云南-8、9为第3组,云南-1、2、11为第4组。云南-3、4为第5组。龙荔为第6组。其余材料为第2组。在遗传相似系数为0.745是将第2组分为5亚组。云南-6、7、10和灵山6份材料为第1亚组。越南的7份材料和泰国依登为第2亚组。来自泰国的泰国-1、2、3及泰国依器和苗翘为第3亚组。那陈2份材料为第4亚组。来自崇左的2份材料和龙州的材料为第5亚组。

2.4基于SCoT和ISSR综合数据的主坐标分析

为了更好地反映材料间的亲缘关系,进行主坐标分析(图3b),所反映的结果与UPGMA聚类分析结果相似。第一、第二、第三主坐标贡献率分别为8.42%、7.40%和6.56%。

3讨论

3.1SCoT和ISSR分子标记结果比较

本实验用12条多态性好的SCoT引物,平均每条扩增10.58条带,共扩增出127个DNA位点,其中108个位点具有多态性,占总位点的85.04%,说明供试的样品遗传多样性比较丰富。另外本试验选用的15条多态性高的ISSR引物,平均每条引物扩增7.8条带。平均多态率达到79.5%。显示了ISSR标记的高效性。从聚类图中可以看出,无论是SCoT分子标记还是ISSR分子标记数据的聚类图基本可以将供试材料分开。两种结果虽有一定的差异,但是从总体上来看结果大致相同。说明SCoT和ISSR分子标记是进行龙眼种质遗传多样性分析和亲缘关系分析中的有效工具。如果将两种标记方法综合分析,这样将进一步缩小了单一标记的误差,取得更加准确的实验结果。

3.2龙眼种质资源的遗传多样性与亲缘关系

本实验中的龙眼SCoT和ISSR扩增结果表明,龙眼的遗传相似系数在0.518-0.896和0.617-0.975,平均为0.707和0.796,说明供试龙眼种质的遗传多样性并不是很高,这与许奇志,易干军等的研究结果类似。在两种标记中崇左-1和崇左-2的遗传相似系数都为最高,可能是在这个区域龙眼种质没有与外界发生交流。通过本研究还可以看出,云南材料遗传分化较大,并且在遗传距离上相差较远。造成这一现象可能因为云南作为世界龙眼起源中心之一,种质资源丰富,分布范围广,这些特性都有利于遗传变异的产生和保持,促进了居群之间基因的频繁交流,从而使云南龙眼资源产生丰富的遗传多样性。这与柯冠武,高慧颖等的研究结果相同。来自越南和泰国的国外材料基本上按各自来源聚类,这与高慧颖,曾黎辉,钟凤林,彭宏祥等的研究结果一致,但本实验中有个别国外材料和中国材料有交叉现象,可能是由于在其它研究中国外材料较少而本实验采用较多的国外材料有关。从本实验的聚类结果可以看出,大部分材料按地理分布聚到一起。但是,有些不同产地材料地理距离远而遗传距离却比较相近,这可能是由于人为交流,造成种质材料交流,因此本实验认为不能简单按地区单独聚类。

3.3特殊种质

对四季蜜的起源,大部分研究者抱审慎态度,因此一直没有可靠定论。本实验的SCoT分子标记结果显示四季蜜与云南-10亲缘关系最近,而ISSR分子标记结果显示四季蜜与云南-7的遗传相似系数最高,将两种分子标记的数据综合进行分析,结果四季蜜与龙州-1遗传相似系数最高,为0.734,其次云南-10相似系数为0.732。

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